上海市自來水市南有限公司的組織機構
總工程師室、總經濟師室； 公司辦公室、勞動人事部、財務資產部、企業管理部、生產技術部、供水業務部、水質管理部、計算機信息部、基建部、審計室、業務發展中心、客戶服務中心、保衛科、退管會等。政工機構
紀委、工會、團委；黨群工作部（宣傳、組織、武裝部等） 上海南市自來水廠（分支機構〕
上海長橋自來水廠 （分支機構）
上海徐涇自來水廠（分支機構）
泵站管理所（分支機構）
生產服務保障部（分支機構）
營業所（分支機構）
管線管理所（分支機構）
二次供水管理所（分支機構）
上海市自來水市南養護工程有限公司（子公司）
上海自來水青東設備工程有限公司（子公司）
上海申中自來水項目管理有限公司（子公司）