南斯拉夫解體的分裂和戰爭
斯洛文尼亞 – 在1990年12月23日舉行的公投中，88.5%的投票者支持獨立（投票率94.8%）。
斯洛文尼亞在1991年6月25日宣布獨立。
克羅地亞 – 在1991年5月2日舉行的公投中，93.24%的投票者支持獨立，克羅地亞在1991年6月25日宣布獨立。
馬其頓 – 在1991年9月8日舉行的公投中，95.26%的投票者支持獨立，馬其頓在1991年9月25日宣布獨立。
波黑 – 在1992年2月29日和3月1日舉行的公投中，92.7%的投票者支持獨立，波黑在1992年3月3日宣布獨立。
斯洛文尼亞、克羅地亞和波黑於1992年5月22日加入聯合國，馬其頓於1993年4月8日加入聯合國。 在1991年1月，KOS（南斯拉夫的反間諜組織）公開了壹個秘密會議的視頻，在視頻中，有克羅地亞人國防部長馬丁·斯皮格爾和兩個其他人出現。斯皮格爾宣傳他們正在和聯邦軍隊作戰，並對另外二人下達了要求走私武器的指示，並傳授了如何處理駐紮在克羅地亞城市的南斯拉夫軍隊的方法，隨後軍隊試圖起訴斯皮格爾，理由是叛國和試圖非法進口武器。
克羅地亞軍隊被發現進口武器以對付在克寧的事態。波黑、克羅地亞、馬其頓和斯洛文尼亞均選出了傾向獨立的政府。斯洛文尼亞要求尊重公投的結果並獨立，南斯拉夫面臨迫在眉梢的瓦解危機。
在1991年3月12日，南斯拉夫人民軍和聯邦主席團的主席會面，軍隊試圖說服主席南斯拉夫進入緊急狀態，這將使得軍隊控制國家。南斯拉夫軍隊的總參謀長維利科·卡迪耶維奇認為，破壞國家的陰謀正在進行，他聲稱：
破壞南斯拉夫的卑劣計劃正在實施。其第壹步是內戰，第二步是外國介入。並且在南斯拉夫各地建立傀儡政權。——維利科·卡迪耶維奇、1992年3月12日
這壹聲明意味著要求獨立的各***和國政府是西方國家的爪牙，必須清除。克羅地亞代表斯捷潘·梅西奇對此十分憤怒，認為約維奇和卡迪耶維奇為了實現大塞爾維亞而試圖動用軍隊力量。而約維奇和卡迪耶維奇則批評“這就是戰爭”，對各***和國代表要求他們同意實施戒嚴令，並聲稱不實施戒嚴令的話南斯拉夫就會崩潰。在這場會議上，提出了為了終結在克羅地亞的危機，以及承認保護塞爾維亞人的軍事行動而實施戒嚴令的提案。表決因波黑代表中塞爾維亞人的反對而被否決。波黑代表認為，仍有不使用武力通過和平方式解決問題的可能，反對實施戒嚴令。聯邦主席團在此之後很快閉會。約維奇的聯邦主席團主席任期在會議後結束，約維奇阻止次任主席克羅地亞人斯捷潘·梅西奇就職，而讓親近米洛舍維奇的黑山政府的布蘭科·科斯蒂奇就任主席之職。
在1991年5月19日，克羅地亞舉行了決定是否獨立的公民投票。83.56%的選民參加了投票，而塞爾維亞人則抵制投票。94.17%的投票者支持克羅地亞獨立（占總數的78.69%，1.2%則表示反對。）
斯洛文尼亞和克羅地亞都在1991年6月25日宣布獨立。翌日（6月26日），聯邦主席團下令軍隊要控制南斯拉夫各***和國的邊界。然而，南斯拉夫人民軍並不願意在自己的國土上進行戰爭。1991年7月7日，在世界各國的施壓之下，南斯拉夫聯邦和斯洛文尼亞及克羅地亞達成為期三個月的停火協定，稱為布裏歐尼協定。斯洛文尼亞和克羅地亞暫緩獨立三個月，在這個期間中，南斯拉夫軍隊必須完全從斯洛文尼亞撤離。
恢復南斯拉夫聯邦的談判在歐洲***同體和彼得·卡靈頓計劃方案之時以失敗告終。在卡靈頓的計劃中，南斯拉夫將分階段解體，各***和國承認聯邦其他構成***和國的獨立。作為交換，歐洲諸國對米洛舍維奇政權保證居住在塞爾維亞國王的塞爾維亞人將得到保護。然而米洛舍維奇並不同意這個計劃。歐洲***同體並沒有解體南斯拉夫的權利，並且這項計劃將塞爾維亞人分割在塞爾維亞、黑山、波黑、克羅地亞四國，有損塞爾維亞人的利益。卡靈頓提議就這項計劃在各***和國實施公民投票。莫米爾·布拉托維奇統治的黑山最初同意這項計劃。然而，由於塞爾維亞的米洛舍維奇施壓，黑山改變了自身立場，反對這項解體南斯拉夫的計劃。 在1991年3月底4月初，發生了十六湖事件，克羅地亞獨立戰爭爆發，交戰雙方是克羅地亞政府和克拉依納自治區的塞爾維亞人叛軍（得到了塞爾維亞人控制的南斯拉夫人民軍的支持）。1991年4月1日，克拉依納自治區宣布它將自克羅地亞獨立。克羅地亞宣布獨立後，克羅地亞的塞爾維亞人也立即宣布建立西斯拉沃尼亞和東斯拉沃尼亞·巴拉亞·西斯雷姆自治組織。在1991年12月19日，這三個地區被合並入塞爾維亞克拉伊納***和國。而克羅地亞東部的其他塞爾維亞人勢力也聲稱他們要加入塞爾維亞克拉伊納***和國。薩格勒布開始停止向貝爾格萊德繳交稅款，而克羅地亞的塞爾維亞人也拒絕給薩格勒布納稅。在壹些地方，南斯拉夫軍隊扮演了緩沖區的角色。而在其他地方，他們幫助塞爾維亞人對抗克羅地亞軍隊和警察、
在南斯拉夫解體的過程中，仇外和民族間的關系緊張在克羅地亞獨立戰爭中明顯體現。克羅地亞和塞爾維亞雙方都在政治宣傳中煽動對對方的恐懼，他們為了獲得支持，在宣傳中聲稱自己民族被迫害，並誇大自己民族的死者數。在戰爭初期的數月，塞爾維亞人支配的南斯拉夫陸軍和海軍包圍了聯合國教科文組織世界遺產，克羅地亞小鎮斯普利特和杜布羅夫尼克及其附近的村莊，並對平民聚居區展開炮擊。作為塞爾維亞的政治宣傳，南斯拉夫的媒體宣稱攻擊的理由是因為這些城市有烏斯塔沙”的軍隊和國際恐怖分子藏匿。而根據聯合國的調查，杜布羅夫尼克並沒有這些武裝力量。克羅地亞軍隊的戰力在此之後增加。當時和米洛舍維奇有盟友關系的黑山總理米洛·久卡諾維奇趁此機會宣揚黑山民族主義，聲稱若杜布羅夫尼克被控制，黑山的領土將可擴大至杜布羅夫尼克。黑山的民族主義者主張杜布羅夫尼克在歷史上屬於黑山。並且如今黑山的國境是由古板且無知的布爾什維克的地圖制作者劃定的。同時，塞爾維亞政府否定了其盟友黑山政府的這些說法。塞爾維亞總理德拉古·澤萊諾維奇聲稱杜布羅夫尼克在歷史上屬塞爾維亞，並不屬於黑山。各國的每天對塞爾維亞攻擊杜布羅夫尼克十分關註，並報道這是米洛舍維奇在南斯拉夫解體過程中試圖建設大塞爾維亞的證據。這些報道指出，米洛舍維奇在其黑山盟友和塞爾維亞民族主義者的支持下，為了奪取杜布羅夫尼克試圖獲得黑山的支持。
在武科瓦爾，克羅地亞人和塞爾維亞人民族間的緊張在南斯拉夫軍隊入城時發展為暴力。南斯拉夫軍隊和塞爾維亞人準軍事組織通過城鎮戰占領了城市，破壞克羅地亞人的資產。塞爾維亞人武裝勢力對克羅地亞人施展暴行，殺害了超過200人，其他克羅地亞人則被強制驅逐出武科瓦爾。這個事件在之後被稱為武科瓦爾屠殺。 1991年到1992年期間，在多民族居住的波斯尼亞與黑塞哥維納，民族間的關系也日益緊張。波黑議會被多數派的波斯尼亞人（穆斯林）和少數派的塞爾維亞人、克羅地亞人黨派所分裂。1991年，塞爾維亞人黨派中勢力最大的塞爾維亞民主黨的領導人、激進派民族主義者拉多萬·卡拉季奇對波黑的波斯尼亞人總統直接警告稱，波黑若從南斯拉夫分離，對波黑和居住在波黑的波斯尼亞人都將會是毀滅性的，並做出如下發言：
妳們正在做的事情不是好事。試圖將波黑據為己有的妳們的做法，和斯洛文尼亞及克羅地亞壹樣，是通往地獄的高速公路。如果妳們覺得妳們並沒有將波黑送往地獄，那麽穆斯林人也將走向滅絕。如果在這裏發生，穆斯林人是無法保護自己的。——拉多萬·卡拉季奇、1991年10月14日。在這裏“穆斯林”是指波斯尼亞人。
1991年，塞爾維亞總統米洛舍維奇和克羅地亞總統圖季曼曾秘密談判將波黑瓜分為塞爾維亞人和克羅地亞人統治區，以回避在波黑發生戰爭。在波黑，波黑的塞爾維亞人於1991年11月舉行公投，其結果顯示大多數投票支持波黑繼續和塞爾維亞及黑山留在壹個國家內。
在公***場合，塞爾維亞的親體制派媒體對外宣稱，波黑將會基於民主政治，加入新的南斯拉夫。然而，波黑政府並沒有認真接受這個提案。 在馬其頓獨立公投中，95.26%的投票者支持馬其頓獨立。在1991年9月，馬其頓也宣布獨立。有五百名美軍士兵被聯合國派駐至馬其頓，監視馬其頓和塞爾維亞的北部邊境。然而，貝爾格萊德並沒有幹預馬其頓的獨立，也沒有對馬其頓的獨立提出抗議。南斯拉夫並未阻止聯合國的行動，並且承認了馬其頓的獨立，和馬其頓樹立的外交關系。馬其頓因而成為南斯拉夫各***和國中唯壹壹個在獨立過程中沒有被武裝幹涉的國家。馬其頓的首任總統基羅·格利戈羅夫和貝爾格萊德及各前南斯拉夫***和國都維持了友好關系。不過，馬其頓和塞爾維亞之間仍然有邊境問題以及普雷舍沃谷地問題。