奧古斯托·皮諾切特的政變奪權
1973年9月政變後，成立了由陸軍、海軍、空軍和警察部隊各壹名代表組成的軍人執政委員會（皮諾切特為陸軍代表、何塞·特雷波·梅裏諾為海軍代表、古斯塔沃·雷·古斯曼為空軍代表、塞薩爾·門多薩為警察部隊代表）皮諾切特擔任主席，原本計劃由這四人輪流領導，但之後皮諾切特的地位得到了鞏固，1974年6月成為國家元首，年底當選為總統，並將自己的軍銜晉升至大元帥。
皮諾切特執政後，在全國範圍內實行戒嚴和宵禁，終止實施憲法，解散議會，禁止政黨活動，限制集會與新聞自由，並對持不同政見者嚴加鎮壓。1974年7月，政府頒布575號法令決定，全國劃分為12個大區和壹個首都聯邦區。4年後頒布2339號法令，根據各大區的地理、文化、民族和歷史特點加以正式命名。1980年頒布新憲法，規定皮諾切特執政到1988年，屆時舉行公民投票，如獲得多數支持，可繼續執政到1997年；如得不到多數支持，則於1989年12月舉行總統和議會選舉。 皮諾切特掌權後，組建了壹支特別警察部隊，專門從事被稱為“骯臟戰爭”的鎮壓行動。對前政府的殘余支持者進行了殘酷的鎮壓。軍政權立即取締了所有左翼政黨。對被視為社會主義和馬克思主義的同情者則采用暴力鎮壓，壹些公開反對政府的人士也遭到迫害。而協助皮諾切特發動軍事政變的24名將軍，在政變成功之後的4年內，有19人突然死亡或失蹤。軍政府中的空軍代表古斯塔沃·雷·古斯曼曾多次表示反對皮諾切特擴充個人權勢，並表示出對皮諾切特政策的不滿，因此遭到了皮諾切特的報復，1978年7月24日，他被逐出軍政府。
皮諾切特掌權期間，有約1.35萬名公民遭逮捕，以卡車帶走並遭到監禁。有5000人最後被關在聖地亞哥的兩座大足球體育館。在國家體育館中，死亡取代足球成為公眾表演。士兵巡視露天座位區，押著戴頭套的告密者指認“顛覆分子”；被指名的人遭拖進更衣室，而包廂則被改裝成臨時酷刑室。數百人被處死。死屍開始出現在主要公路邊，或浮屍於汙濁的市區運河。
在智利的外籍居民和移民也遭到皮諾切特的鎮壓，80余名西班牙移民被殺害，加拿大修女遭到酷刑，傾向於阿連德的瑞士等國國民被暗殺。壹些異議人士被捕後遭嚴刑拷打致死，被用直升機運到太平洋上空拋下去，從此消失無蹤。
嚴刑拷打也是軍政府鎮壓異己的常用手段。成千上萬的智利人因此出逃國外。2004年，”政治犯與酷刑”國家委員會發布報告稱，大約有35,000人聲稱遭到了軍政權的酷刑折磨。其中有28,000份證詞被認為是合法的。該報告同時認為，超過半數的逮捕行動發生於軍人執政後數月內（大約有18,000人稱他們是在1973年9月至12月間遭到拘禁的）。
1976年9月，智利形勢引起了國際關註。前智利駐美國大使，阿連德政府內閣成員奧蘭多·勒特裏爾在華盛頓特區遭汽車炸彈襲擊身亡。而在此之前2年，前任陸軍總司令卡洛斯·普拉茨也在阿根廷布宜諾斯艾利斯遇刺身亡。前總統愛德華多·弗雷·蒙塔爾瓦在1976年宣布反對軍政府侵犯人權的行為，但6年後弗雷在壹次常規手術後神秘死亡。有人推測他死於政府之手。
皮諾切特當政17年間遇難人士的具體數目至今不詳。智利“真相與和解”國家委員會1991年發布的報告認為，有2095人遇害，1102人失蹤。還有統計數據顯示有13萬人遭到逮捕，6.5萬名政治犯失蹤，上萬人流亡國外。