重慶醫科大學的學術研究
據2015年12月學校官網信息顯示，學校有國家級、省部級研究機構28個，其中國家工程研究中心1個、國家生物產業基地實驗動物中心1個、教育部重點實驗室3個、省部***建國家重點實驗室培育基地1個、省級工程研究中心5個，省級重點實驗室16個，省級人文社科基地1個。
教育部重點實驗室：感染性疾病分子生物學教育部重點實驗室、臨床檢驗診斷學教育部重點實驗室、兒童發育疾病研究教育部重點實驗室
國家生物產業基地實驗動物中心：重慶醫科大學重慶國家生物產業基地實驗動物中心
省級人文社科基地：醫學與社會發展研究中心
國家工程研究中心：超聲醫學國家工程研究中心
省級工程研究中心：重慶市刑事偵查工程技術研究中心、重慶市幹細胞治療工程技術研究中心、重慶市藥物工程研究中心、重慶市藥效評價工程技術研究中心、重慶市嚙齒類實驗動物工程技術研究中心 省級重點實驗室（名單不全） 脂糖代謝性疾病重慶市重點實驗室感染性疾病分子生物學重慶市重點實驗室臨床檢驗診斷學重慶市重點實驗室 兒童發育疾病研究重慶市重點實驗室眼科學重慶市市級重點實驗室認知發育與學習記憶障礙轉化醫學重慶市重點實驗室超聲醫學工程重慶市市級重點實驗室生物化學與分子藥理學重慶市高校市級重點實驗室神經病學重慶市高校市級重點實驗室超聲分子影像學重慶市醫學重點實驗室婦產科學重慶市醫學重點實驗室肝膽外科學重慶市醫學重點實驗室傳染病寄生蟲病重慶市醫學重點實驗室 十二五”期間，學校牽頭承擔國家科技重大專項、國家重大科研儀器研制專項、國家重大科學研究計劃項目、國家重點基礎研究發展計劃（973計劃）項目、國家高技術發展研究計劃（863計劃）項目、國家科技計劃支撐項目、教育部新世紀優秀人才項目、國家自然科學基金項目540余項。獲各類科技成果獎勵110余項，其中重慶市科學技術獎、何梁何利獎等省部級以上獎勵40余項。
學校獨立研制的高強度聚焦超聲腫瘤治療系統（海扶刀）屬世界首創，是中國第壹臺具有完全自主知識產權的大型醫療設備。實現產業化以來，海扶系列設備已在全國1000余家醫院投入使用，出口歐盟、俄羅斯、日本、韓國、新加坡等數十個國家和地區。2011年底，學校申請的國家重大科研儀器研制專項——“球形聚焦集聲系統”項目獲得國家自然科學基金委員會6000萬元資助。 2012年度重慶醫科大學新上科研項目壹覽表序號項目名稱起止時間項目來源經費（萬元）負責人1超聲波腫瘤治療技術培訓班2012科技部41.187王智彪2乙型肝炎治療和轉歸相關新指標和新試劑的臨床意義評價2012-2015重大專項任務189.45唐霓3脂質異常分布在NAFLD和高脂血癥發病中的作用2012-2016“973”子課題275.0阮雄中4膽固醇代謝紊亂促進慢性腎臟病進展和腎纖維化的分子機制2012-2015“973”子課題115.20阮雄中5代謝性炎癥在NAFLD和高脂血癥發病中的作用2012-2015“973”子課題50.00陳壓西6“十二五”國家科技支撐項目“中國重要心血管病患率調查”2012國家“十二五”科技支撐子課題69.64雷寒7MSM人群性行為前後服抗病毒藥物預防HIV新感染研究2012-2015國家“十二五”科技重大專項任務319.56黃愛龍8雲南及周邊省市區傳染病病原譜流行規律研究2012-2015國家“十二五”科技重大專項任務96.51黃愛龍159BMP9和WNT3A雙基因調控骨髓間充質幹細胞對骨折後骨不連的協同成骨作用研究2012教育部壹般3.50劉渤160LXR激活在全腦缺血性腦損傷後海馬神經發生的作用機制2012-2014教育部壹般2.80承歐梅161早期營養過剩誘發和加重成年後非酒精性脂肪肝病形成的分子機制研究2012教育部博士點基金聯合6.0肖曉秋162BKCa通道在偏頭痛動物模型中的表達及其機制研究2012教育部博士點基金聯合2.0譚戈163Th17/Treg失衡在腎移植慢性排斥反應中的作用及其幹預研究2012教育部博士點基金聯合2.0何雲鋒164色素上皮衍生因子通過NO-cGMP-PKG信號通路促進胰島素抵抗2012-2014教育部博士點基金12.00李啟富165Snail/E-cadherin在前體心外膜祖細胞向起搏細胞定向分化中的調控作用2012-2014教育部博士點基金12.00佘強166納秒級高強電脈沖對卵巢癌侵襲轉移的影響的實驗研究2012-2014教育部博士點基金12.00胡麗娜167HBV X蛋白下調線粒體蛋白SIRT3在HBV感染誘導的氧化應激反應中的作用及機制研究2012-2014教育部博士點基金4.00陳娟168孕期MVAD對仔鼠生後突觸可塑性翻譯調節機制的影響2012-2014教育部博士點基金4.00張萱169Wasp基因突變對濕疹血小板減少伴免疫缺陷綜合征臨床表型和Treg/Th17細胞免疫功能的影響2012教育部博士點基金聯合2.0張誌勇170乳腺癌Bmi-1靶基因的高通量篩選2012教育部博士點基金聯合2.0武向梅171手性自組裝短肽對創傷中快速止血的機制探索與模型建立2012教育部博士點基金聯合2.0羅忠禮172表觀遺傳調控的差異miRNA在乳腺癌發生中的作用及其分子機制研究2012-2014教育部博士點基金12.00宋方洲173細胞原纖毛轉運蛋白80（IFT80）通過Hedgehog 信號通路調控乳腺癌細胞分化和增殖2012-2014教育部博士點基金4.00汪長東174人參皂苷Rg1延緩神經幹細胞衰老與調控端粒長度與端粒酶活性的機理研究2012-2014教育部博士點基金12.00王亞平175新世紀優秀人才2013-2015教育部新世紀優秀人才25.00郭風勁176KLF14改善糖脂代謝紊亂及其分子機制的研究2012-2014教育部博士點基金12.00李伶177探索靶向Bcr-Abl Y177去磷酸化和降解的策略逆轉CML細胞惡性表型2012-2014教育部博士點基金12.00馮文莉178Twist促進乳腺腫瘤幹細胞聚集的關鍵miRNAs和細胞信號通路研究2012-2014教育部博士點基金聯合12.00柳滿然179特異性抑制缺失型CENP-E對實體腫瘤發生的影響2012教育部博士點基金聯合6.00翁亞光180尿硫酸化膽汁酸代謝輪廓分析用於妊娠肝內膽汁淤積癥的診斷和分度2012教育部博士點基金聯合6.00丁敏181低強度聚集超聲對子宮內膜異位癥患者在位內膜細胞的粘附、侵襲、血管形成的影響2012教育部博士點基金聯合6.00王智彪182受體介導與超聲定位雙重靶向--載姜黃素的甘草次酸表面修飾納米粒與超聲微泡復合給藥系統的研究2012-2014教育部博士點基金4.00張良珂183具有類骨質孔狀再生通道的承力納米復合支架修復兔橈骨骨缺損的成骨機制研究2012-2014教育部博士點基金4.00盧旻鵬184行為經濟學視角下煙草控制政策優化研究2012-1015教育部人文青年基金7.00浦科學 學術期刊 《中華肝臟病雜誌》（Chinese Journal of Hepatology）是中華醫學會主辦、重慶醫科大學第二臨床學院病毒性肝炎研究所承辦的全國性學術期刊。創刊於1993年6月，初刊名《肝臟病雜誌》，1996年正式更名為《中華肝臟病雜誌》，主要內容包括肝臟的生理、各種肝臟疾病的病原學、流行病學、病理、病理生理、免疫學、發病機理、臨床診斷治療及預防的實踐經驗和研究成果、以及新技術、新方法的重要進展。
《臨床超聲醫學雜誌》1988年8月創刊。1998年11月經國家科委批準為正式刊物，在中國國內外公開發行。2004年被中國科學技術部收錄為“中國科技論文統計源期刊”、 “中國科技核心期刊”， 且先後加入了“中國學術期刊光盤網”、“萬方數據數字化期刊網”，被“中文生物醫學期刊文獻數據庫”、“中文科技期刊數據庫”、“全國醫藥衛生優秀成果數據庫”及“中國核心期刊（遴選）數據庫”收錄。
《重慶醫科大學學報》由重慶醫科大學主辦，是中文核心、中國科技核心、CSCD遴選和中國高校優秀科技期刊。被美國化學文摘（CA）、波蘭《哥白尼索引》（IC）、美國《烏利希期刊指南》、世界衛生組織《西太平洋地區醫學索引》、美國《劍橋科學文摘（自然科學）》、中國知網、維普科技、萬方數據等重要數據庫全文收錄。
《兒科藥學雜誌》由中國藥學會醫院藥學專業委員會兒科藥學專業組與重慶醫科大學附屬兒童醫院聯合主辦。1995年創刊，2000年8月經國家新聞出版總署和科技部批準正式向國內外公開發行。已成為兒科學類核心期刊，《中國學術期刊綜合評價數據庫》來源期刊、《中國核心期刊（遴選）數據庫》收錄期刊，《中國學術期刊（光盤版）》和《中國期刊網》、《首席醫學網》、《萬方數據—數字化期刊群》全文上網，《中文科技期刊數據庫》、《中文生物醫學文摘文獻庫（CMCC）》全文收載，《中國藥學文摘》、《中國藥學文獻數據庫》和《中文科技資料目錄—醫藥衛生》收錄源期刊。
《醫學教育探索》於2002年創刊，2011年正式更名為《中華醫學教育探索雜誌》（Chinese Journal of Medical Education Research），月刊，是由中國科學技術協會主管、中華醫學會主辦的醫學教育專業核心期刊，主要反映中國國內外最新醫學教育動態、教育教學改革成果、醫學領域內的社會、心理、倫理和法律等內容。雜誌已被中國科技論文統計源（中國科技核心期刊）、波蘭哥白尼索引（IC）、WHO西太平洋地區醫學索引（WPRIM）、美國《烏利希期刊指南》（UPD）等重要數據庫收錄。 館藏資源 2013年底，學校擁有館藏文獻 149.64 萬冊，其中全文電子期刊 27715 種、電子圖書 234929 冊、其他電子資源 70469 冊（件），中外數據庫資源 30 余個，生均擁有紙質圖書 46 冊。2013 年，增加紙質圖書 13.56 萬冊，生均年進書量超過 4 冊，增加電子圖書 4.06 萬冊、續訂電子期刊 2.77 萬種、增加其他電子資源 3.12 萬冊；紙質圖書借還量 38.87 萬冊次，數據庫訪問 187.89 萬人次，電子期刊全文下載 182.06 萬篇，電子圖書閱讀使用 11.94 萬本，多媒體光盤及多媒體資源利用 15.53 萬次。同時建有Medline光盤數據庫（含SERFILE期刊信息數據庫）、維普中文科技期刊數據庫、中國生物醫學文獻數據庫（CBMdisc） 、中文生物醫學期刊/會議文獻數據庫-CMCC/CMAC 、重醫學位論文數據庫、萬方中國學位論文數據庫（醫學）等數據庫。