藥王廟的建築
廟的主要建築分東、西兩部分，西部是寺廟形式：山門門額鐫刻“敕封藥王廟”，門前原有兩尊大鐵獅子，進山門有壹對大旗桿，每年臘月至正月底，旗桿上掛大紅燈籠，旗桿後有報時的鐘、鼓樓。
南藥王廟有三層大殿。第壹層大殿為藥王殿，面闊3間，東、西兩側配殿各3間。正殿中供奉伏羲、神農、黃帝塑像及藥聖孫思邈、藥王韋茲藏。大殿兩側，分別站立十大名醫。東配殿供馬王爺和龍王爺，西配殿供月下老人。第二層正殿和配殿與第壹層的建築形式、規模相同。正殿為玉皇殿，供奉玉皇大帝，東站立四大天王，西列兵器。東配殿供鬥母娘娘，西配殿供奉九位聖母。第三層大殿是三清殿，面闊5間，正中供奉玉清元始天尊、上清靈寶天尊、太清太上老君。兩側分別供著道教所信奉的其他十幾位天神。三清殿兩側設有配殿，院內東、西兩邊立著30余座石碑，碑文分別為修建各大殿時知名人士的題詞和題記，今均已無存。在三清殿正西，與它並排而立的還有壹座二層小樓，樓下是關公殿，樓上為唐明皇殿。 東部的建築貫穿在南北軸線上。與山門並列平行的有壹排臨街罩房，面對罩房第壹層殿是呂祖殿，供奉八仙之中的呂洞賓，其後有文昌殿、真武殿。真武殿後有壹座戲樓，戲樓北是藥王寢宮，宮內供奉著藥王爺和十大名醫，在它西邊還有壹個小配殿，供財神爺趙公明。
最後是壹棟二層上下開問各七間半的木樓，樓上供奉東王公、太陽公、東嶽大帝、竈王爺、南北五祖等幾十位神像，多為木雕或銅鑄，樓下存放祭神的用品雜物。東邊有七、八個小院落，多為僚舍。
東部廟房多已拆除，西部除山門以外，主要三層大殿及配殿至今尚保存完整。為崇文區重點保護文物。