雙信封評標法的國家基本藥物采購的“雙信封”招標制度
在基本藥物制度運行過程中，有些地方在招標過程中“為低價是取”，引起社會對於基本藥物質量的擔心，對此，《采購機制》重申，基本藥物采購要遵循各質量優先、價格合理的原則。
安徽省基本藥物招標工作中采用的“雙信封”招標制度，在《采購機制》中受到推薦，“鼓勵各地采用”。這壹招標制度在編制標書時要求分別編制經濟技術標書和商務標書，企業同時投兩份標書。
經濟技術標書主要對企業生產規模、配送能力、銷售額、行業排名、市場信譽，以及GMP(GSP)資質認證、藥品質量抽驗抽查歷史情況、電子監管能力等指標進行評審，保證基本藥物質量。只有經濟技術標書評審合格的企業才能進入商務標書評審，商務標書評審由價格最低者中標。
除了通過制度設計加強質量管理，基本藥物制度還將完善電子監管和供應信息系統。SFDA將完善全國統壹的基本藥物信息條形碼和藥品電子監管平臺，對基本藥物進行全品種電子監管。《采購機制》要求，從2011年4月1日期，各省市（區、市）不得采購未入藥品電子監管網未使用基本藥物信息條形碼統壹表示的企業供應的基本藥物。
此外，基本藥物采購還建立“黑名單制度”，對出現惡意壓低價格、供應質量不達標藥品等行為的企業，有關部門將采取清除出全國藥品招標采購市場的處罰措施。