中國醫藥大學附設醫院的院區配置
臺中總院區：位於臺中市學士路與育德路上，主要分為第壹、第二（兒童）、第三（立夫）、美德（中醫）、復建醫療大樓，病床***有1141張。
五權院區：位於臺中市五權路與學士路口，於2007年11月16日在臺中市長伉儷胡誌強、邵曉鈴剪彩下正式啟用。五權院區主要做為急重癥中心及癌癥中心，內部約有700張病床。頂樓設有醫療用圓形停機坪可供直升機運送傷患。
豐原分院：豐原區中正路199號，原豐原英醫院，2008年更名。
臺中東區分院：東區自由路三段296號，原全家醫院，2008年更名。
臺中監獄培德醫院：南屯區培德路9號（臺中監獄行政大樓壹樓），2002年4月委由中國附醫經營，就醫對象僅限臺中監獄收容人，未對外營業。
中科員工診所：位於臺中市大雅區中科路6-6號1樓（中科管理局壹樓），2006年5月正式營運 北港醫院：又稱媽祖醫院，位於雲林縣北港鎮，原為北港朝天宮籌資興建但未完工之媽祖醫院，後由中國附醫接手，1985年11月28日正式成立運作，並於2008年起正式升格為區域教學醫院，***設急性病床300床、特殊病床129床（包含加護病房及呼吸照護病房），並提供護理之家的服務。
虎尾農會診所：位於虎尾鎮光復路185號，2002年3月起委由中國附醫北港院經營，醫療人員由臺中與北港兩院區支援。
1999年10月起，中國醫藥大學北港與臺中兩附設醫院合並營運，為同屬中國醫療體系之北港院所。 臺北分院：位於臺北市內湖區內湖路二段360號，於2008年10月28日正式營運。主要定位為社區醫療照護，設有壹般門診、急診、住院、健檢中心、洗腎中心，提供外診以及居家照護。衛生署評鑒地區醫院優等。